사업양수도 vs 주식양수도 세금 비교 계산기
2026년 최신 세율 기준으로 사업양수도와 주식양수도 시 매도인·매수인의 세부담을 비교해보세요.
양도소득세, 취득세, 부가세, 증권거래세, 과점주주 간주취득세까지 종합 분석합니다.
📋 샘플 시나리오
🔄 기본 거래 정보
사업양수도 자산 구성
사업양수도 시 양도할 자산의 구성과 취득가액을 입력하세요.
🏢 부동산 (토지·건물)
⚙️ 기계·장비
주식양수도 정보
비상장법인 지분 50% 초과 취득 시 과점주주 간주취득세 발생
사업양수도 vs 주식양수도 세금 비교란?
기업을 인수하거나 매각할 때, 거래 방식에 따라 세금이 크게 달라진다는 사실을 알고 계신가요?
사업양수도는 사업체의 자산(부동산, 기계장비, 영업권 등)을 개별적으로 양도하는 방식이고, 주식양수도는 법인의 주식을 양도하여 경영권을 이전하는 방식입니다.
두 방식은 양도소득세, 취득세, 부가가치세, 증권거래세 등 적용되는 세법이 완전히 다르기 때문에, 거래 구조에 따라 수천만 원에서 수억 원까지 세금 차이가 발생할 수 있습니다.
본 계산기는 2026년 최신 세율을 기준으로 사업양수도와 주식양수도 시 매도인·매수인 각각의 세부담을 산출하고,
어떤 거래 방식이 유리한지 종합적으로 비교 분석해드립니다.
포괄양수도 부가세 면제, 과점주주 간주취득세, 영업권 기타소득세, 장기보유특별공제 등 복잡한 세금 요소를 자동으로 계산합니다.
이런 분들에게 유용합니다
- • M&A(인수합병)를 검토 중인 사업주 또는 투자자
- • 사업 매각을 준비하는 법인 대표 또는 개인사업자
- • 거래 구조별 세금 차이를 비교하려는 세무사·회계사
- • 스타트업 인수·합병 절차를 검토하는 경영자
- • 사업 승계(가업승계) 방법을 고민하는 가족기업 오너
- • 부동산이 많은 법인의 인수 세금을 확인하려는 투자자
사업양수도와 주식양수도의 차이
사업양수도란?
사업양수도는 법인의 주식이 아닌, 사업 자체를 구성하는 자산과 부채를 양도하는 거래 방식입니다.
매수인은 부동산, 기계장비, 재고자산, 영업권 등 원하는 자산만 선택적으로 인수할 수 있으며,
불필요한 부채는 승계하지 않을 수 있다는 장점이 있습니다.
- • 부동산 양도: 양도차익에 대해 양도소득세(6%~45%) 과세, 매수인은 취득세 4.6% 부담
- • 영업권 양도: 기타소득으로 분류, 60% 필요경비 인정 후 나머지 40%에 대해 종합소득세율 적용
- • 기계·장비: 양도차익에 대해 양도소득세 과세
- • 재고자산: 사업소득으로 과세
- • 부가가치세: 개별양수도 시 과세(10%), 포괄양수도 시 면제
주식양수도란?
주식양수도는 대상 법인의 주식을 양도하여 경영권을 이전하는 방식입니다.
법인 자체는 그대로 유지되므로 인허가, 계약관계, 고용관계가 자동으로 승계됩니다.
그러나 법인의 잠재부채(세금 체납, 소송 등)도 함께 승계되는 위험이 있습니다.
- • 주식 양도소득세: 비상장 중소기업 10%, 비중소기업 20~25%, 상장 대주주 20~25%
- • 증권거래세: 비상장 0.35%, 코스피 0.03%, 코스닥 0.15%
- • 과점주주 간주취득세: 비상장법인 지분 50% 초과 시 법인 보유 부동산에 대해 2.4% 과세
- • 부가가치세: 주식 거래는 부가가치세 비과세
- • 영업권: 주식 가액에 포함되어 별도 과세 없음
핵심 세금 비교 포인트
1. 영업권(Goodwill) 과세 차이
M&A에서 가장 큰 세금 차이를 만드는 요소가 바로 영업권입니다.
사업양수도 시 영업권은 기타소득으로 별도 과세되며, 양도가액의 40%에 대해 종합소득세율(6%~45%)이 적용됩니다.
반면 주식양수도 시 영업권은 주식 가액에 포함되어 주식 양도소득세율(10%~25%)만 적용됩니다.
예시: 영업권 5억원인 경우
- • 사업양수도: 5억 × 40% = 2억 과세 → 종합소득세 약 5,400만원 + 지방세 540만원
- • 주식양수도(중소기업): 영업권 포함 양도차익 전체에 10% → 약 5,000만원
2. 부가가치세(VAT) 차이
사업양수도 시 자산 양도에 대해 부가가치세 10%가 과세됩니다.
다만, 포괄양수도(사업 전체를 일괄 양도)에 해당하면 부가가치세가 면제됩니다.
주식양수도는 주식 거래이므로 부가가치세가 아예 과세되지 않습니다.
포괄양수도 요건: 사업에 관한 모든 권리와 의무를 포괄적으로 양도·양수하는 것.
일부 자산만 선택적으로 양수하면 포괄양수도로 인정되지 않을 수 있습니다.
3. 취득세 차이
사업양수도 시 매수인은 부동산에 대해 취득세 4.6%를 부담합니다.
주식양수도 시에는 원칙적으로 취득세가 없지만, 비상장법인 지분 50%를 초과하여 취득하면 과점주주 간주취득세(2.4%)가 법인 보유 부동산에 대해 부과됩니다.
부동산 비중이 높은 법인일수록 과점주주 간주취득세의 영향이 커집니다.
다만, 사업양수도의 취득세율(4.6%)보다는 간주취득세율(2.4%)이 낮으므로, 매수인 입장에서는 주식양수도가 유리할 수 있습니다.
4. 장기보유특별공제 적용
사업양수도로 부동산을 양도할 때, 3년 이상 보유한 경우 장기보유특별공제를 받을 수 있습니다.
보유기간에 따라 6%~30%까지 양도차익에서 공제됩니다.
15년 이상 보유 시 최대 30% 공제로 상당한 절세 효과가 있습니다.
주식양수도에서는 장기보유특별공제가 적용되지 않습니다.
따라서 장기 보유 부동산이 많은 법인이라면, 사업양수도가 매도인에게 유리할 수 있습니다.
사용 방법
1단계: 기본 거래 정보 입력
총 거래금액, 법인 유형(중소기업/비중소기업), 상장 여부를 입력합니다.
포괄양수도 해당 여부를 체크하면 부가가치세 면제가 자동 적용됩니다.
2단계: 사업양수도 자산 구성 입력
부동산(양도가·취득가·보유기간), 기계장비, 재고자산, 영업권의 가액을 입력합니다.
각 자산별 양도차익과 세금이 자동으로 계산됩니다.
3단계: 주식양수도 정보 입력
매도인의 주식 취득가액, 매수인의 기존·양수 후 지분율, 법인 보유 부동산 가액을 입력합니다.
과점주주 간주취득세 해당 여부가 자동으로 판단됩니다.
4단계: 결과 확인
"세금 비교 계산" 버튼을 클릭하면 사업양수도와 주식양수도의 세부담을 비교합니다.
매도인·매수인별 상세 세금 내역, 장단점 비교표, 절세 팁을 확인할 수 있습니다.
실전 활용 시나리오
시나리오 1: 부동산 비중 높은 음식점 인수
상가 건물이 포함된 음식점을 인수할 때, 부동산 비중이 높으면 사업양수도 시 취득세 부담이 큽니다.
포괄양수도로 진행하면 VAT를 면제받을 수 있으므로, 포괄양수도 요건 충족 여부를 먼저 확인하세요.
매수인 입장에서는 주식양수도 시 과점주주 간주취득세(2.4%)가 사업양수도 취득세(4.6%)보다 낮아 유리할 수 있습니다.
다만, 매도인 입장에서의 세금도 함께 비교해야 합니다.
시나리오 2: 기술 스타트업 인수 (영업권 비중 높음)
IT 스타트업은 유형자산보다 기술력, 고객 데이터, 브랜드 가치 등 무형의 영업권 비중이 높습니다.
사업양수도 시 영업권은 기타소득으로 최대 45%까지 과세되지만,
주식양수도 시에는 중소기업 10%의 낮은 세율이 적용됩니다.
영업권 비중이 높은 기업일수록 주식양수도가 매도인에게 훨씬 유리합니다.
다만, 주식양수도 시 법인의 숨은 부채(세금 체납, 미결소송 등)를 사전에 꼼꼼히 조사해야 합니다.
시나리오 3: 제조업 법인 인수 (복합 자산)
부동산, 기계장비, 재고자산, 영업권이 모두 포함된 제조업 법인의 경우 자산 구성 비율에 따라 결과가 달라집니다.
사업양수도와 주식양수도 모두 시뮬레이션해보고 최적의 구조를 선택하는 것이 중요합니다.
대규모 M&A에서는 매도인과 매수인의 이해관계가 다를 수 있으므로, 양쪽 모두의 세금을 계산하여 협상에 활용하세요.
2026년 주요 세율 안내
양도소득세 기본세율
| 과세표준 | 세율 | 누진공제 |
|---|---|---|
| 1,400만원 이하 | 6% | - |
| 1,400만~5,000만원 | 15% | 126만원 |
| 5,000만~8,800만원 | 24% | 576만원 |
| 8,800만~1.5억원 | 35% | 1,544만원 |
| 1.5억~3억원 | 38% | 1,994만원 |
| 3억~5억원 | 40% | 2,594만원 |
| 5억~10억원 | 42% | 3,594만원 |
| 10억원 초과 | 45% | 6,594만원 |
주식 양도소득세율 및 증권거래세율
주식 양도소득세
- • 비상장 중소기업: 10%
- • 비상장 비중소기업: 20% (3억 초과 25%)
- • 상장 대주주: 20% (3억 초과 25%)
증권거래세
- • 비상장: 0.35%
- • 코스피: 0.03%
- • 코스닥: 0.15%
- • 코넥스: 0.10%
자주 묻는 질문 (FAQ)
Q. 사업양수도와 주식양수도 중 어떤 것이 세금이 더 적나요?
A. 자산 구성에 따라 다릅니다.
영업권 비중이 높은 기업은 주식양수도가, 부동산을 장기 보유한 기업은 사업양수도가 유리할 수 있습니다.
본 계산기로 두 방식을 모두 시뮬레이션해보시는 것을 추천합니다.
Q. 포괄양수도란 무엇이고, 어떤 경우에 해당하나요?
A. 포괄양수도는 사업에 관한 모든 권리와 의무를 일괄적으로 양도하는 것입니다.
부가가치세법 제10조 제9항에 따라 부가가치세가 면제되는 큰 혜택이 있습니다.
일부 자산만 선택적으로 양수하거나, 주요 계약·인허가를 제외하면 포괄양수도로 인정되지 않을 수 있습니다.
Q. 과점주주 간주취득세는 무엇인가요?
A. 비상장법인의 주식 50%를 초과하여 취득하면, 해당 법인이 보유한 부동산에 대해 취득세가 부과됩니다.
이를 과점주주 간주취득세라고 하며, 세율은 2.4%(취득세 2% + 지방교육세 0.2% + 농어촌특별세 0.2%)입니다.
주식양수도 시 매수인이 부담하는 주요 세금입니다.
Q. 영업권은 어떻게 과세되나요?
A. 사업양수도 시 영업권은 기타소득으로 분류됩니다.
양도가액의 60%를 필요경비로 인정받고, 나머지 40%에 대해 종합소득세율(6%~45%)이 적용됩니다.
주식양수도에서는 영업권이 주식 가액에 포함되어 별도 과세되지 않습니다.
Q. 매도인과 매수인의 이해관계가 다른 경우 어떻게 하나요?
A. 매도인에게 유리한 방식과 매수인에게 유리한 방식이 다를 수 있습니다.
이 경우 총 세부담을 기준으로 협상하되, 절감된 세금을 거래 가격에 반영하여 조정하는 방법이 일반적입니다.
본 계산기에서 매도인·매수인별 세금을 분리하여 확인할 수 있습니다.
Q. 계산 결과를 그대로 세금 신고에 사용해도 되나요?
A. 본 계산기는 주요 세금 항목을 기반으로 한 추정치입니다.
실제 세금은 자산 감정평가, 부대비용, 특별공제 요건 등에 따라 달라질 수 있으므로,
반드시 세무사·회계사와 상담 후 정확한 세액을 산출하시기 바랍니다.
M&A 절세 전략 팁
- 포괄양수도 요건 충족: 사업양수도를 선택한다면, 포괄양수도 요건을 충족시켜 부가가치세를 면제받으세요.
사업의 모든 권리·의무를 포괄적으로 승계해야 합니다. - 영업권 비중 최소화: 사업양수도 시 영업권 비중이 높으면 세부담이 커집니다.
영업권 가액 산정 근거를 명확히 하고, 합리적인 범위 내에서 배분하세요. - 장기보유특별공제 활용: 부동산을 3년 이상 보유했다면 장기보유특별공제를 최대한 활용하세요.
15년 이상 보유 시 30% 공제가 적용됩니다. - 과점주주 취득세 대비: 주식양수도 시 법인 보유 부동산에 대한 간주취득세를 미리 계산하세요.
부동산 비율이 높은 법인이라면 상당한 금액이 될 수 있습니다. - 전문가 자문 필수: M&A 거래는 금액이 크고 세법이 복잡합니다.
반드시 세무사·회계사·변호사의 자문을 받아 최적의 거래 구조를 설계하세요.
지금 바로 세금을 비교해보세요!
사업양수도와 주식양수도, 어떤 방식이 세금이 적은지 직접 확인하세요.
2026년 최신 세율 기준 · 매도인·매수인 세부담 분리 분석 · 포괄양수도 VAT 면제 자동 적용